Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ephb4P54761 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ephb4P54761 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ephb4P54761 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ephb4P54761 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms