Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc16a1P53986 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc16a1P53986 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms