Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MipP51180 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MipP51180 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MipP51180 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MipP51180 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MipP51180 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MipP51180 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MipP51180 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MipP51180 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MipP51180 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MipP51180 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MipP51180 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MipP51180 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MipP51180 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MipP51180 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MipP51180 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MipP51180 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MipP51180 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MipP51180 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MipP51180 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MipP51180 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MipP51180 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MipP51180 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MipP51180 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MipP51180 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MipP51180 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MipP51180 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MipP51180 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MipP51180 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MipP51180 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MipP51180 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MipP51180 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MipP51180 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MipP51180 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MipP51180 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MipP51180 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MipP51180 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MipP51180 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MipP51180 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MipP51180 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MipP51180 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MipP51180 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MipP51180 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MipP51180 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MipP51180 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MipP51180 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MipP51180 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MipP51180 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MipP51180 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MipP51180 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MipP51180 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MipP51180 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MipP51180 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms