Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lhx3P50481 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lhx3P50481 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx3P50481 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms