Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CitP49025 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CitP49025 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CitP49025 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CitP49025 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CitP49025 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CitP49025 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CitP49025 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CitP49025 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CitP49025 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CitP49025 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CitP49025 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CitP49025 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CitP49025 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CitP49025 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CitP49025 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CitP49025 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CitP49025 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CitP49025 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CitP49025 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CitP49025 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CitP49025 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CitP49025 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CitP49025 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CitP49025 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CitP49025 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CitP49025 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CitP49025 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CitP49025 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CitP49025 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CitP49025 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CitP49025 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CitP49025 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CitP49025 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CitP49025 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CitP49025 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CitP49025 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CitP49025 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CitP49025 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CitP49025 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CitP49025 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CitP49025 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CitP49025 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CitP49025 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CitP49025 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CitP49025 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CitP49025 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CitP49025 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CitP49025 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CitP49025 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CitP49025 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CitP49025 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CitP49025 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CitP49025 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CitP49025 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CitP49025 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CitP49025 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CitP49025 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CitP49025 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CitP49025 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CitP49025 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CitP49025 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CitP49025 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CitP49025 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CitP49025 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CitP49025 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CitP49025 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CitP49025 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CitP49025 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CitP49025 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CitP49025 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CitP49025 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CitP49025 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CitP49025 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CitP49025 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CitP49025 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CitP49025 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CitP49025 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CitP49025 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CitP49025 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CitP49025 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CitP49025 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CitP49025 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CitP49025 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CitP49025 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CitP49025 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CitP49025 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CitP49025 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CitP49025 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CitP49025 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms