Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LmnaP48678 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LmnaP48678 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LmnaP48678 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LmnaP48678 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LmnaP48678 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LmnaP48678 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LmnaP48678 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LmnaP48678 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LmnaP48678 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LmnaP48678 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LmnaP48678 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LmnaP48678 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LmnaP48678 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms