Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr7P47774 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr7P47774 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr7P47774 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms