Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax7P47239 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax7P47239 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pax7P47239 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pax7P47239 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pax7P47239 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pax7P47239 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pax7P47239 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pax7P47239 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax7P47239 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pax7P47239 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax7P47239 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax7P47239 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax7P47239 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms