Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syt1P46096 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syt1P46096 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syt1P46096 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syt1P46096 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syt1P46096 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syt1P46096 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syt1P46096 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syt1P46096 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syt1P46096 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Syt1P46096 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syt1P46096 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt1P46096 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syt1P46096 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms