Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sept1P42209 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sept1P42209 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sept1P42209 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sept1P42209 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sept1P42209 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sept1P42209 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sept1P42209 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept1P42209 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept1P42209 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sept1P42209 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sept1P42209 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sept1P42209 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms