Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ighmbp2P40694 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighmbp2P40694 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ighmbp2P40694 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms