Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddit3P35639 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddit3P35639 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddit3P35639 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddit3P35639 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddit3P35639 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms