Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk4P30285 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk4P30285 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk4P30285 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms