Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cnga1P29974 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cnga1P29974 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cnga1P29974 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnga1P29974 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms