Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mep1aP28825 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mep1aP28825 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mep1aP28825 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms