Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsgP28293 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsgP28293 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsgP28293 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsgP28293 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtsgP28293 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsgP28293 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms