Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gjb3P28231 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gjb3P28231 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb3P28231 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms