Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ChgaP26339 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ChgaP26339 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChgaP26339 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ChgaP26339 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ChgaP26339 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ChgaP26339 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ChgaP26339 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChgaP26339 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ChgaP26339 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ChgaP26339 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms