Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Aldh1a1P24549 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh1a1P24549 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh1a1P24549 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aldh1a1P24549 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms