Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trap1aP19473 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trap1aP19473 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trap1aP19473 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms