Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp53P15975 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp53P15975 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp53P15975 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp53P15975 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp53P15975 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp53P15975 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp53P15975 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp53P15975 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms