Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SptbP15508 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SptbP15508 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SptbP15508 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SptbP15508 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SptbP15508 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SptbP15508 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SptbP15508 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SptbP15508 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SptbP15508 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SptbP15508 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SptbP15508 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SptbP15508 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SptbP15508 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SptbP15508 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SptbP15508 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SptbP15508 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SptbP15508 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SptbP15508 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SptbP15508 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SptbP15508 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SptbP15508 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SptbP15508 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SptbP15508 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SptbP15508 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SptbP15508 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SptbP15508 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SptbP15508 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SptbP15508 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SptbP15508 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SptbP15508 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SptbP15508 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SptbP15508 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SptbP15508 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SptbP15508 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SptbP15508 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SptbP15508 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SptbP15508 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SptbP15508 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SptbP15508 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SptbP15508 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SptbP15508 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SptbP15508 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SptbP15508 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SptbP15508 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SptbP15508 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SptbP15508 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SptbP15508 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SptbP15508 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SptbP15508 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SptbP15508 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SptbP15508 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SptbP15508 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SptbP15508 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SptbP15508 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SptbP15508 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SptbP15508 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SptbP15508 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SptbP15508 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SptbP15508 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SptbP15508 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SptbP15508 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SptbP15508 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SptbP15508 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SptbP15508 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SptbP15508 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SptbP15508 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SptbP15508 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SptbP15508 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SptbP15508 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SptbP15508 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SptbP15508 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SptbP15508 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SptbP15508 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SptbP15508 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SptbP15508 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SptbP15508 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SptbP15508 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SptbP15508 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SptbP15508 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SptbP15508 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SptbP15508 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SptbP15508 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SptbP15508 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SptbP15508 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SptbP15508 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SptbP15508 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SptbP15508 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SptbP15508 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SptbP15508 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SptbP15508 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SptbP15508 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SptbP15508 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SptbP15508 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SptbP15508 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SptbP15508 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SptbP15508 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SptbP15508 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SptbP15508 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SptbP15508 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms