Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolP11369 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolP11369 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolP11369 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolP11369 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolP11369 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PolP11369 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolP11369 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolP11369 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolP11369 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolP11369 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolP11369 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PolP11369 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PolP11369 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PolP11369 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PolP11369 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolP11369 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolP11369 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolP11369 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolP11369 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolP11369 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolP11369 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolP11369 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolP11369 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolP11369 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolP11369 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolP11369 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolP11369 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolP11369 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolP11369 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PolP11369 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolP11369 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolP11369 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolP11369 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolP11369 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolP11369 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolP11369 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolP11369 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolP11369 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolP11369 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolP11369 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolP11369 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolP11369 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolP11369 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolP11369 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolP11369 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolP11369 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PolP11369 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolP11369 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolP11369 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolP11369 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolP11369 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PolP11369 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolP11369 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolP11369 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolP11369 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolP11369 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolP11369 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PolP11369 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolP11369 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolP11369 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PolP11369 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolP11369 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolP11369 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolP11369 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolP11369 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolP11369 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolP11369 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolP11369 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolP11369 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolP11369 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolP11369 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolP11369 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolP11369 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolP11369 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolP11369 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolP11369 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolP11369 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolP11369 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolP11369 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolP11369 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolP11369 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolP11369 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolP11369 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolP11369 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolP11369 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolP11369 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolP11369 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolP11369 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms