Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06334 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06334 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06334 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06334 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06334 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06334 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06334 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06334 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06334 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06334 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06334 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06334 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06334 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06334 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06334 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06334 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06334 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06334 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P06334 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06334 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06334 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06334 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06334 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06334 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06334 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06334 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06334 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06334 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06334 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06334 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P06334 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06334 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06334 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06334 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06334 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06334 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06334 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06334 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06334 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06334 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06334 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P06334 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06334 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06334 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06334 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06334 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06334 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06334 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06334 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06334 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06334 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06334 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06334 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06334 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06334 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06334 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06334 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06334 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P06334 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06334 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06334 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06334 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06334 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06334 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06334 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06334 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06334 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06334 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06334 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06334 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06334 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06334 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06334 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06334 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06334 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06334 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06334 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06334 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06334 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06334 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06334 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06334 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06334 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06334 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06334 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06334 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06334 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms