Protein–RNA interactions for Protein: P04756

Chrna1, Acetylcholine receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna1P04756 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna1P04756 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chrna1P04756 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chrna1P04756 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna1P04756 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms