Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk1P04184 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tk1P04184 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tk1P04184 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tk1P04184 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tk1P04184 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tk1P04184 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tk1P04184 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tk1P04184 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tk1P04184 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk1P04184 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk1P04184 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk1P04184 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk1P04184 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk1P04184 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tk1P04184 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk1P04184 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk1P04184 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk1P04184 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tk1P04184 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tk1P04184 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tk1P04184 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tk1P04184 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tk1P04184 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk1P04184 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk1P04184 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tk1P04184 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk1P04184 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tk1P04184 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tk1P04184 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tk1P04184 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms