Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01837 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01837 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01837 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01837 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01837 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01837 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01837 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01837 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01837 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01837 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01837 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01837 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01837 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01837 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01837 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01837 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01837 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01837 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01837 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01837 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01837 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01837 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01837 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01837 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01837 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01837 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01837 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01837 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01837 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01837 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01837 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01837 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01837 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01837 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01837 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01837 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01837 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01837 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01837 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01837 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01837 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01837 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01837 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01837 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01837 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01837 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01837 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01837 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01837 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01837 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01837 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01837 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01837 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01837 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01837 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01837 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01837 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01837 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01837 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01837 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01837 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01837 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01837 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms