Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01820 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01820 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01820 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01820 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01820 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
P01820 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01820 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P01820 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01820 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01820 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01820 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01820 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01820 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01820 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01820 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01820 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01820 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01820 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01820 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01820 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01820 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01820 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01820 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01820 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01820 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01820 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01820 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01820 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01820 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01820 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01820 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01820 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01820 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01820 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01820 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01820 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01820 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01820 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01820 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01820 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01820 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01820 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01820 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01820 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01820 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01820 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01820 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01820 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01820 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01820 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01820 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
P01820 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01820 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01820 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01820 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01820 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01820 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01820 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01820 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01820 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01820 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01820 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms