Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01748 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01748 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01748 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01748 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01748 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01748 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01748 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01748 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01748 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01748 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01748 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01748 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01748 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01748 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01748 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01748 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01748 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01748 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01748 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01748 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01748 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01748 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01748 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01748 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01748 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01748 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01748 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01748 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01748 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01748 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01748 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01748 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01748 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01748 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
P01748 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01748 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01748 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01748 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01748 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01748 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01748 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01748 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01748 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01748 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01748 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01748 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01748 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01748 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01748 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01748 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01748 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01748 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01748 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01748 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01748 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01748 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01748 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01748 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01748 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01748 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01748 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01748 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms