Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01740 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01740 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01740 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01740 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01740 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01740 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01740 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01740 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01740 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01740 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01740 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01740 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01740 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01740 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01740 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
P01740 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01740 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01740 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01740 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01740 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01740 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01740 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01740 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P01740 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01740 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01740 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01740 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01740 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01740 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01740 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P01740 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01740 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01740 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01740 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01740 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01740 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01740 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01740 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01740 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01740 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01740 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01740 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01740 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01740 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01740 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01740 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01740 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01740 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01740 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01740 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01740 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01740 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01740 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01740 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01740 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01740 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01740 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01740 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01740 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01740 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01740 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01740 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01740 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01740 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01740 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01740 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01740 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01740 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01740 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01740 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01740 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01740 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01740 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01740 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01740 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01740 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01740 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01740 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01740 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01740 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01740 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01740 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01740 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01740 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01740 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01740 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01740 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01740 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01740 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
P01740 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01740 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01740 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01740 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P01740 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01740 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01740 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01740 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01740 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01740 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms