Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
P01734 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01734 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01734 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01734 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01734 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01734 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01734 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01734 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01734 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01734 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
P01734 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01734 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01734 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01734 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01734 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01734 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01734 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01734 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01734 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01734 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01734 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01734 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01734 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01734 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01734 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01734 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01734 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01734 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01734 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01734 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01734 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01734 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01734 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01734 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01734 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01734 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01734 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01734 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01734 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01734 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01734 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
P01734 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01734 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01734 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01734 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01734 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01734 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01734 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01734 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01734 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01734 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01734 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01734 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01734 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01734 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01734 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01734 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
P01734 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01734 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
P01734 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01734 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
P01734 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01734 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01734 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01734 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01734 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01734 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01734 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01734 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01734 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01734 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01734 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01734 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01734 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01734 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01734 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01734 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01734 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
P01734 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01734 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01734 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01734 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01734 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01734 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01734 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01734 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01734 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01734 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
P01734 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms