Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01649 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01649 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01649 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01649 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P01649 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01649 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01649 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01649 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01649 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01649 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01649 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01649 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01649 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01649 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01649 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01649 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01649 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01649 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01649 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01649 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01649 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01649 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01649 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01649 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01649 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01649 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01649 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01649 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01649 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01649 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01649 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01649 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01649 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01649 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01649 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01649 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01649 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01649 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01649 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01649 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01649 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01649 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01649 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01649 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01649 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01649 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01649 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01649 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01649 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01649 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01649 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01649 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01649 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01649 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01649 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01649 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01649 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01649 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01649 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01649 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01649 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01649 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01649 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01649 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01649 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01649 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01649 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01649 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01649 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01649 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01649 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01649 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01649 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01649 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01649 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms