Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc6O88978 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc6O88978 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc6O88978 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc6O88978 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms