Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pak1O88643 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pak1O88643 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pak1O88643 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pak1O88643 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pak1O88643 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pak1O88643 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pak1O88643 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pak1O88643 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pak1O88643 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pak1O88643 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pak1O88643 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pak1O88643 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pak1O88643 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pak1O88643 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pak1O88643 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pak1O88643 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pak1O88643 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.8 ms