Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrp6O88572 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrp6O88572 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrp6O88572 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrp6O88572 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lrp6O88572 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrp6O88572 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrp6O88572 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms