Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Klc1O88447 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Klc1O88447 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc1O88447 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc1O88447 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc1O88447 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc1O88447 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc1O88447 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klc1O88447 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klc1O88447 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klc1O88447 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc1O88447 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc1O88447 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc1O88447 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc1O88447 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc1O88447 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms