Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms