Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb5O70309 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb5O70309 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb5O70309 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms