Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmx1O70218 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hmx1O70218 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmx1O70218 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms