Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp2a2O55143 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms