Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Sema6bO54951 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sema6bO54951 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema6bO54951 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Sema6bO54951 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sema6bO54951 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sema6bO54951 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Sema6bO54951 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sema6bO54951 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sema6bO54951 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms