Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarce1O54941 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarce1O54941 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarce1O54941 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarce1O54941 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms