Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rdh16O54909 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16O54909 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms