Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EdaO54693 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EdaO54693 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EdaO54693 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EdaO54693 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EdaO54693 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EdaO54693 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EdaO54693 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EdaO54693 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EdaO54693 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EdaO54693 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EdaO54693 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EdaO54693 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EdaO54693 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EdaO54693 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EdaO54693 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EdaO54693 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EdaO54693 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EdaO54693 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EdaO54693 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EdaO54693 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EdaO54693 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EdaO54693 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EdaO54693 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EdaO54693 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EdaO54693 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EdaO54693 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EdaO54693 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EdaO54693 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EdaO54693 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EdaO54693 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EdaO54693 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EdaO54693 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EdaO54693 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EdaO54693 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EdaO54693 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EdaO54693 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EdaO54693 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EdaO54693 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EdaO54693 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EdaO54693 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EdaO54693 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EdaO54693 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EdaO54693 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EdaO54693 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EdaO54693 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EdaO54693 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EdaO54693 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EdaO54693 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EdaO54693 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EdaO54693 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EdaO54693 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EdaO54693 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EdaO54693 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EdaO54693 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EdaO54693 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EdaO54693 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EdaO54693 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EdaO54693 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EdaO54693 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EdaO54693 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EdaO54693 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EdaO54693 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EdaO54693 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EdaO54693 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EdaO54693 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EdaO54693 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EdaO54693 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EdaO54693 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EdaO54693 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EdaO54693 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EdaO54693 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EdaO54693 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EdaO54693 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EdaO54693 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EdaO54693 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EdaO54693 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EdaO54693 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EdaO54693 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EdaO54693 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EdaO54693 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EdaO54693 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EdaO54693 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EdaO54693 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EdaO54693 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EdaO54693 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EdaO54693 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EdaO54693 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EdaO54693 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EdaO54693 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EdaO54693 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EdaO54693 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EdaO54693 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EdaO54693 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EdaO54693 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EdaO54693 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EdaO54693 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EdaO54693 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EdaO54693 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EdaO54693 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms