Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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Psmb10O35955 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Psmb10O35955 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Psmb10O35955 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb10O35955 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Psmb10O35955 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Psmb10O35955 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Psmb10O35955 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Psmb10O35955 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb10O35955 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb10O35955 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb10O35955 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms