Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn1mwO35599 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn1mwO35599 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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