Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gfra2O08842 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfra2O08842 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gfra2O08842 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfra2O08842 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms