Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrkcshO08795 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrkcshO08795 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcshO08795 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PrkcshO08795 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms