Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nfil3O08750 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nfil3O08750 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nfil3O08750 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfil3O08750 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms