Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp35M0QWN7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp35M0QWN7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp35M0QWN7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms